Cognex Deep Learning 軟體可針對更大部分的晶圓執行自動化缺陷篩選。缺陷探測工具可完全忽略底下的晶圓層，即使是在晶圓層任意處的小缺陷也能發現，然後剔除任何異常者。其也可用於兩層式檢測系統，識別模稜兩可的情況，以及送到離線人工檢測站，以供進一步檢閱。